农合机构应针对案发原因进行检视回溯，制定整改方案，建立整改台账，明确整改措施，确定整改期限，落实整改责任，认真进行整改，并于报送案件审结报告后45个工作日内向监管部门报告整改落实情况，并及时组织开展案件警示教育。